MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 plasmid p3META1

Total Repeats: 318

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012810	CGGC	2	8	3580	3587	0 %	0 %	50 %	50 %	240114608
2	NC_012810	CGG	2	6	3593	3598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114608
3	NC_012810	GAA	2	6	3623	3628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240114608
4	NC_012810	GC	3	6	3644	3649	0 %	0 %	50 %	50 %	240114608
5	NC_012810	TGA	2	6	3677	3682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240114608
6	NC_012810	CCTG	2	8	3705	3712	0 %	25 %	25 %	50 %	240114608
7	NC_012810	GGT	2	6	3720	3725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240114608
8	NC_012810	CCGG	2	8	3776	3783	0 %	0 %	50 %	50 %	240114608
9	NC_012810	CGA	2	6	3840	3845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114608
10	NC_012810	CG	3	6	3852	3857	0 %	0 %	50 %	50 %	240114608
11	NC_012810	GCG	2	6	3876	3881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114608
12	NC_012810	ACC	2	6	3919	3924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240114608
13	NC_012810	GAGC	2	8	3948	3955	25 %	0 %	50 %	25 %	240114608
14	NC_012810	GC	3	6	3954	3959	0 %	0 %	50 %	50 %	240114608
15	NC_012810	TGC	2	6	3980	3985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114608
16	NC_012810	TG	3	6	4023	4028	0 %	50 %	50 %	0 %	240114608
17	NC_012810	ACG	2	6	4037	4042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114608
18	NC_012810	AGG	2	6	4043	4048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240114608
19	NC_012810	GCT	2	6	4052	4057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114608
20	NC_012810	GC	3	6	4073	4078	0 %	0 %	50 %	50 %	240114608
21	NC_012810	GGC	2	6	4088	4093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114608
22	NC_012810	CGGCA	2	10	4153	4162	20 %	0 %	40 %	40 %	240114608
23	NC_012810	CGC	2	6	4183	4188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114608
24	NC_012810	TGC	2	6	4200	4205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114608
25	NC_012810	GCC	2	6	4219	4224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114608
26	NC_012810	GAC	2	6	4226	4231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114608
27	NC_012810	GGC	2	6	4240	4245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114608
28	NC_012810	GGT	2	6	4260	4265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240114608
29	NC_012810	CCAG	2	8	4329	4336	25 %	0 %	25 %	50 %	240114608
30	NC_012810	GAT	2	6	4345	4350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240114608
31	NC_012810	CGG	2	6	4506	4511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114608
32	NC_012810	CT	3	6	4513	4518	0 %	50 %	0 %	50 %	240114608
33	NC_012810	GCA	2	6	4521	4526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114608
34	NC_012810	GCC	3	9	4534	4542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114608
35	NC_012810	GAA	2	6	4551	4556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240114608
36	NC_012810	CCG	2	6	4768	4773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114609
37	NC_012810	GTG	2	6	4800	4805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240114609
38	NC_012810	GGGC	2	8	4830	4837	0 %	0 %	75 %	25 %	240114609
39	NC_012810	CGG	2	6	4866	4871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114609
40	NC_012810	GGC	2	6	4891	4896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114609
41	NC_012810	CGGG	2	8	4898	4905	0 %	0 %	75 %	25 %	240114609
42	NC_012810	TCC	2	6	4941	4946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240114609
43	NC_012810	CCG	2	6	5010	5015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114609
44	NC_012810	GAG	2	6	5018	5023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240114609
45	NC_012810	TCG	2	6	5055	5060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114609
46	NC_012810	CTT	2	6	5077	5082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240114609
47	NC_012810	GTT	2	6	5099	5104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240114609
48	NC_012810	GGA	3	9	5128	5136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240114609
49	NC_012810	GAT	2	6	5365	5370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240114610
50	NC_012810	CGG	2	6	5489	5494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114610
51	NC_012810	TA	3	6	5556	5561	50 %	50 %	0 %	0 %	240114610
52	NC_012810	ACC	2	6	5653	5658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240114611
53	NC_012810	GC	4	8	5786	5793	0 %	0 %	50 %	50 %	240114611
54	NC_012810	CGTC	2	8	5838	5845	0 %	25 %	25 %	50 %	240114611
55	NC_012810	CGTC	2	8	5877	5884	0 %	25 %	25 %	50 %	240114611
56	NC_012810	GC	3	6	5943	5948	0 %	0 %	50 %	50 %	240114611
57	NC_012810	GGCG	2	8	6023	6030	0 %	0 %	75 %	25 %	240114611
58	NC_012810	CGC	2	6	6070	6075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114611
59	NC_012810	CGA	2	6	6187	6192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114611
60	NC_012810	CAT	2	6	6200	6205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240114611
61	NC_012810	GCAA	2	8	6220	6227	50 %	0 %	25 %	25 %	240114611
62	NC_012810	CGA	2	6	6302	6307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114612
63	NC_012810	GCG	2	6	6311	6316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114612
64	NC_012810	ACG	2	6	6325	6330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114612
65	NC_012810	CGG	2	6	6347	6352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114612
66	NC_012810	CGG	2	6	6363	6368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114612
67	NC_012810	GCC	2	6	6412	6417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114612
68	NC_012810	GGA	2	6	6465	6470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240114612
69	NC_012810	GGC	2	6	6489	6494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114612
70	NC_012810	CGT	2	6	6531	6536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114612
71	NC_012810	CGGCG	2	10	6558	6567	0 %	0 %	60 %	40 %	240114612
72	NC_012810	CGGTG	2	10	6570	6579	0 %	20 %	60 %	20 %	240114612
73	NC_012810	TCG	2	6	6587	6592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114612
74	NC_012810	CGCGG	2	10	6634	6643	0 %	0 %	60 %	40 %	240114612
75	NC_012810	CGG	2	6	6681	6686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114612
76	NC_012810	CGGC	2	8	6690	6697	0 %	0 %	50 %	50 %	240114612
77	NC_012810	GTG	2	6	6709	6714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240114612
78	NC_012810	CGT	2	6	6753	6758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114612
79	NC_012810	CCG	2	6	6793	6798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114612
80	NC_012810	GCCG	2	8	6849	6856	0 %	0 %	50 %	50 %	240114612
81	NC_012810	ATG	2	6	6978	6983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240114613
82	NC_012810	GCC	2	6	6984	6989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114613
83	NC_012810	CCG	2	6	7059	7064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114613
84	NC_012810	GCC	2	6	7082	7087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114613
85	NC_012810	CTC	2	6	7090	7095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240114613
86	NC_012810	GCC	2	6	7115	7120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114613
87	NC_012810	CCG	2	6	7235	7240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114613
88	NC_012810	TGGCCG	2	12	7267	7278	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	240114613
89	NC_012810	CTC	2	6	7375	7380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240114614
90	NC_012810	ACG	2	6	7466	7471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114614
91	NC_012810	GCG	2	6	7482	7487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114614
92	NC_012810	AGC	2	6	7493	7498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114614
93	NC_012810	CGA	2	6	7527	7532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114614
94	NC_012810	ATG	2	6	7627	7632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240114614
95	NC_012810	CCG	2	6	7830	7835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114614
96	NC_012810	GGCG	2	8	7853	7860	0 %	0 %	75 %	25 %	240114614
97	NC_012810	GAA	2	6	8089	8094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240114615
98	NC_012810	GC	3	6	8150	8155	0 %	0 %	50 %	50 %	240114615
99	NC_012810	GTC	2	6	8260	8265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114615
100	NC_012810	CGC	2	6	8280	8285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114615
101	NC_012810	CGC	2	6	8301	8306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114615
102	NC_012810	GCAC	2	8	8363	8370	25 %	0 %	25 %	50 %	240114615
103	NC_012810	GCT	2	6	8382	8387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114615
104	NC_012810	GAA	2	6	8409	8414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240114615
105	NC_012810	CAC	2	6	8440	8445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240114615
106	NC_012810	CAT	2	6	8520	8525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240114616
107	NC_012810	GTT	2	6	8546	8551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240114616
108	NC_012810	GCT	2	6	8583	8588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114616
109	NC_012810	GCA	3	9	8620	8628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114616
110	NC_012810	CCT	2	6	8633	8638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240114616
111	NC_012810	TCG	2	6	8659	8664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114616
112	NC_012810	CCG	2	6	8996	9001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114617
113	NC_012810	AGGCGG	2	12	9004	9015	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	240114617
114	NC_012810	CG	3	6	9019	9024	0 %	0 %	50 %	50 %	240114617
115	NC_012810	CGC	2	6	9065	9070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114617
116	NC_012810	GC	3	6	9152	9157	0 %	0 %	50 %	50 %	240114617
117	NC_012810	GCC	2	6	9256	9261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114617
118	NC_012810	GCC	2	6	9270	9275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114617
119	NC_012810	CCGC	2	8	9288	9295	0 %	0 %	25 %	75 %	240114617
120	NC_012810	GGA	2	6	9361	9366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240114617
121	NC_012810	GCC	2	6	9373	9378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114617
122	NC_012810	GGC	2	6	9395	9400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114617
123	NC_012810	ACC	2	6	9420	9425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240114617
124	NC_012810	GCT	2	6	9461	9466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114617
125	NC_012810	GTC	2	6	9513	9518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114617
126	NC_012810	GGAG	2	8	9568	9575	25 %	0 %	75 %	0 %	240114617
127	NC_012810	G	7	7	9598	9604	0 %	0 %	100 %	0 %	240114617
128	NC_012810	G	6	6	9689	9694	0 %	0 %	100 %	0 %	240114617
129	NC_012810	AGCG	2	8	9696	9703	25 %	0 %	50 %	25 %	240114617
130	NC_012810	TCA	2	6	9863	9868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240114618
131	NC_012810	GCG	2	6	9997	10002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114618
132	NC_012810	GCT	2	6	10307	10312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114619
133	NC_012810	GAA	2	6	10341	10346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240114619
134	NC_012810	CCT	2	6	10370	10375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240114619
135	NC_012810	CTC	2	6	10569	10574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240114619
136	NC_012810	AAG	2	6	10575	10580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240114619
137	NC_012810	AGC	2	6	10952	10957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114620
138	NC_012810	CGGA	2	8	10962	10969	25 %	0 %	50 %	25 %	240114620
139	NC_012810	GGGC	2	8	11063	11070	0 %	0 %	75 %	25 %	240114620
140	NC_012810	CGG	2	6	11239	11244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114620
141	NC_012810	TCC	2	6	11274	11279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240114620
142	NC_012810	TGG	2	6	11293	11298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240114620
143	NC_012810	CGG	2	6	11330	11335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114620
144	NC_012810	CAG	2	6	11369	11374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114620
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146	NC_012810	GGA	2	6	11444	11449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240114621
147	NC_012810	CTGAC	2	10	11468	11477	20 %	20 %	20 %	40 %	240114621
148	NC_012810	AGG	2	6	11504	11509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240114621
149	NC_012810	GGA	2	6	11514	11519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240114621
150	NC_012810	AGG	2	6	11630	11635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240114621
151	NC_012810	TGG	2	6	11636	11641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240114621
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154	NC_012810	CGA	2	6	11682	11687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114621
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157	NC_012810	CAT	2	6	11784	11789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240114621
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159	NC_012810	GCGCC	2	10	12030	12039	0 %	0 %	40 %	60 %	240114621
160	NC_012810	TGG	2	6	12050	12055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240114621
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163	NC_012810	GC	3	6	12162	12167	0 %	0 %	50 %	50 %	240114621
164	NC_012810	TGA	2	6	12168	12173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240114621
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168	NC_012810	TCG	2	6	12491	12496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114621
169	NC_012810	TCA	2	6	12509	12514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240114621
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172	NC_012810	CGGCCT	2	12	12669	12680	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	240114621
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260	NC_012810	TGC	2	6	16790	16795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114631
261	NC_012810	TTC	2	6	16799	16804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240114631
262	NC_012810	AAGGC	2	10	16821	16830	40 %	0 %	40 %	20 %	240114631
263	NC_012810	AAT	2	6	16875	16880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240114631
264	NC_012810	CGG	2	6	16899	16904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114631
265	NC_012810	ACG	2	6	17204	17209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114632
266	NC_012810	CGA	2	6	17274	17279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114632
267	NC_012810	GC	3	6	17374	17379	0 %	0 %	50 %	50 %	240114632
268	NC_012810	CGA	2	6	17382	17387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114632
269	NC_012810	CGA	2	6	17451	17456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114632
270	NC_012810	GCG	2	6	18704	18709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114633
271	NC_012810	GGC	2	6	18711	18716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114633
272	NC_012810	CGG	2	6	18720	18725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114633
273	NC_012810	GCG	2	6	18758	18763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114633
274	NC_012810	GCG	2	6	18787	18792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114633
275	NC_012810	CGA	2	6	18874	18879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114633
276	NC_012810	GCCT	2	8	18899	18906	0 %	25 %	25 %	50 %	240114633
277	NC_012810	GGT	2	6	18928	18933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240114633
278	NC_012810	GGT	2	6	18941	18946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240114633
279	NC_012810	TC	3	6	19528	19533	0 %	50 %	0 %	50 %	240114634
280	NC_012810	GCG	2	6	19578	19583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114634
281	NC_012810	GCC	2	6	19605	19610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114634
282	NC_012810	TCC	2	6	19710	19715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240114634
283	NC_012810	CAT	2	6	19799	19804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240114634
284	NC_012810	CGC	2	6	19825	19830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114634
285	NC_012810	GGTG	2	8	19856	19863	0 %	25 %	75 %	0 %	240114634
286	NC_012810	GAT	2	6	19925	19930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240114634
287	NC_012810	GAC	2	6	19943	19948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114634
288	NC_012810	AGCC	2	8	19955	19962	25 %	0 %	25 %	50 %	240114634
289	NC_012810	CAC	2	6	19976	19981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240114634
290	NC_012810	GCT	2	6	20023	20028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114634
291	NC_012810	GGA	2	6	20042	20047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240114634
292	NC_012810	GTCCGT	2	12	20163	20174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114634
293	NC_012810	CAG	2	6	20322	20327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114635
294	NC_012810	CGGG	2	8	20415	20422	0 %	0 %	75 %	25 %	240114635
295	NC_012810	CCA	2	6	20445	20450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240114635
296	NC_012810	GCC	2	6	20474	20479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114635
297	NC_012810	CGC	2	6	20507	20512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114635
298	NC_012810	GCG	2	6	20577	20582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114635
299	NC_012810	CGGC	2	8	20587	20594	0 %	0 %	50 %	50 %	240114636
300	NC_012810	AGC	2	6	20634	20639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114636
301	NC_012810	GC	3	6	20644	20649	0 %	0 %	50 %	50 %	240114636
302	NC_012810	GCCG	2	8	20707	20714	0 %	0 %	50 %	50 %	240114636
303	NC_012810	CGG	2	6	20747	20752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114636
304	NC_012810	CGC	2	6	20790	20795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114636
305	NC_012810	AC	3	6	20813	20818	50 %	0 %	0 %	50 %	240114636
306	NC_012810	CGGC	2	8	21024	21031	0 %	0 %	50 %	50 %	240114637
307	NC_012810	CAC	2	6	21046	21051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240114637
308	NC_012810	G	6	6	21087	21092	0 %	0 %	100 %	0 %	240114637
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310	NC_012810	TCGGT	2	10	21114	21123	0 %	40 %	40 %	20 %	240114637
311	NC_012810	TCC	2	6	21133	21138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240114637
312	NC_012810	GAG	2	6	21169	21174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240114637
313	NC_012810	GC	3	6	21178	21183	0 %	0 %	50 %	50 %	240114637
314	NC_012810	CAA	2	6	21214	21219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240114637
315	NC_012810	GCC	2	6	21220	21225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114637
316	NC_012810	GGC	2	6	21237	21242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114637
317	NC_012810	CATTGC	2	12	21243	21254	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	240114637
318	NC_012810	GCG	2	6	21292	21297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114637

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.